Die Geschäftsprüfungskommission (GPK) der Gemeinde Flawil hat sich ebenfalls mit dem durch die Bau- und Infrastrukturkommission verhängten Baustopp befasst. Nach Prüfung der Unterlagen hält die GPK fest, dass aus ihrer Sicht der Entscheid der Flawiler Behörden korrekt war, was durch das kantonale Bau- und Umweltdepartement bestätigt wurde.